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COORDONNEES


Hélicases & ARN : mécanismes, ciblage et bio-mimétisme


CONTACTS


 Marc BOUDVILLAIN 
 Responsable d'équpe 

 

Tél : 02.38.25.55.85

 
 Fax : 02.38.63.15.17 
 Mail : marc.boudvillain@cnrs-orleans.fr 
MOTS-CLEFS


  • Arn hélicases
  • Bio-ingénierie de l'arn
  • Biochimie combinatoire
  • Enzymologie
THEMATIQUE


L'équipe étudie les mécanismes biochimiques et biologiques d'enzymes ATP-dépendantes ubiquitaires appelées hélicases. La fonction des hélicases est d'ouvrir les doubles hélices d'ADN et d'ARN et de remodeler les assemblages nucléoprotéiques, en collusion avec (ou au sein) de grosses machineries cellulaires (appareils de réplication, transcription, traduction, etc.). Acteurs essentiels du métabolisme cellulaire, les hélicases sont impliquées dans divers mécanismes infectieux, maladies génétiques et cancers. Ce sont des cibles pharmacologiques intéressantes mais encore peu exploitées. L'équipe développe des stratégies innovantes basées sur ses expertises en bio-ingénierie de l'ARN, biochimie combinatoire et enzymologie pour déchiffrer les mécanismes d'action des hélicases et pour identifier des composés régulateurs à des fins de ciblage thérapeutique et de conception de « nano-engins » biomimétiques.

DOMAINES DE COMPETENCE


  • Biochimie de l'arn et de ses protéines associées
  • Métabolisme arn
  • Moteurs moléculaires atp-dépendants
  • Transcription bactérienne
APPLICATIONS CONCRETES


- Préparation de substrats ARNs non accessibles par synthèse chimique. Ces substrats peuvent éventuellement contenir des modifications ponctuelles, utiles pour l'étude de leur interaction avec des enzymes d'intérêt comme les hélicases.
- Développement de tests d'activité hélicase pouvant être utilisés pour la recherche de molécules inhibitrices/activatrices par criblage à haut débit (HTS).
- Identification de sites de fixation à l'ARN de molécules d'intérêt (hélicases, protéines, etc.).
- Design de ligands ARN optimisés pour une fonction biochimique d'intérêt (hélicase, par exemple).

SAVOIR-FAIRE


  • Bio-ingénierie de l'arn
  • Biochimie combinatoire (interférence, « empreintes », etc.)
  • Transcription in vitro
  • Purification d'enzymes et de protéines du métabolisme arn
  • Tests enzymatiques en conditions transitoires et stationnaires
EQUIPEMENTS PARTICULIERS


- Systèmes pour eléctrophorèse et purification des acides nucléiques.
- Instrument de cinétique/mélange rapides (Microvolume Quench Flow QFM400).
- Imageurs moléculaires par radiodétection/fluorescence (Typhoon Trio et Storm 860; instruments CBM).

SECTEURS D'APPLICATIONS


  • Santé, médical
  • Pharmaceutique
  • Diagnostic
  • Nanotechnologies, biomatériaux
SERVICES / PRESTATIONS


- Préparation d'ARNs par transcription in vitro.
- Purification et marquages post-transcriptionnels d'ARNs (P-32, fluorophore, biotine, etc).
- Identification de sites d'interaction ARN-protéine, ARN-drogue, etc.
- Tests d'activités hélicase et ATPase, d'interaction ARN-protéine.
- Préparation de mélanges réactionnels (µvolumes) par contrôle cinétique rapide (ms-s).